En Belgique, le programme de surveillance des eaux usées permet de suivre la circulation de trois virus respiratoires d’importance pour la santé public. Le programme de surveillance a débuté en septembre 2020 avec le SARS-CoV-2, le virus responsable de la COVID-19. En janvier 2024, l'influenza (le virus responsable de la grippe) et le virus respiratoire syncytial (VRS) ont été ajoutés. La surveillance couvre 38% de la population belge et est basée sur l'analyse d'échantillons d'eaux usées prélevés une fois par semaine. Ces échantillons sont collectés chaque le lundi pendant une période de 24 heures, dans les influents de 30 stations d'épuration réparties sur l'ensemble du territoire belge, principalement dans des zones à forte densité de population. Les échantillons sont analysés pour détecter la présence du SARS-CoV-2, de la grippe et du VRS.